Βάσει του Κανονισμού Λειτουργίας, εντός του Εθνικού Δρυμού Σαμαριάς (ΦΕΚ 5266 Β/2024) απαγορεύεται:

Η καταστροφή ή απομάκρυνση τεχνικών έργων, υποδομών, εξοπλισμού & υλικών του Εθνικού Δρυμού.
Η μεταφορά κοπτικών εργαλείων, η κοπή δένδρων & θάμνων, το ξερίζωμα & η συλλογή φυτών και σπόρων και γενικά κάθε φθορά της βλάστησης και της χλωρίδας.
Η συλλογή και μεταφορά φυτοχώματος και καυσόξυλων.
Το άναμμα φωτιάς γενικά.
Το κάπνισμα παρά μόνο στους χώρους με σαφή και ευδιάκριτη σήμανση.
Η κατασκήνωση με οποιαδήποτε μορφή (σκηνές κ.λπ.) και η διανυκτέρευση εντός του Δρυμού.
Η ελεύθερη κυκλοφορία ζώων συντροφιάς που συνοδεύουν επισκέπτες. Η συνοδεία ζώου συντροφιάς επιτρέπεται μόνο με ιμάντα (λουρί) υπό την εποπτεία και την ευθύνη του συνοδού του.
Η κυκλοφορία παντός είδους τροχοφόρων, ποδηλάτων, δικύκλων κ.λπ.
Η επίδειξη και η τοποθέτηση οποιωνδήποτε πινακίδων και σημάτων πλην των πινακίδων και σημάτων που τοποθετούνται από τους αρμόδιους φορείς.
Η πώληση τροφίμων και άλλων αντικειμένων καθώς και η κατά οιονδήποτε τρόπο έκθεση και διανομή αυτών.
Η κατανάλωση αλκοολούχων ποτών.
Το κυνήγι κάθε ζώου με οποιοδήποτε μέσο σε όλη τη διάρκεια του έτους.
Η κατοχή και χρήση πυροτεχνημάτων, βενζίνης, εκρηκτικών και λοιπών συναφών αντικειμένων και όπλων, ακόμη και λυμένων σε θήκη.
Η παροχή τροφής σε όλα τα είδη άγριας πανίδας.
Η αφαίρεση ή καταστροφή φωλιών, αυγών ή νεοσσών και γενικά η ενόχληση και καταστροφή των ειδών της πανίδας. Απαγορεύεται η αναίτια πρόκληση θορύβου καθώς και η χρήση συσκευών ή εξοπλισμών που παράγουν ήχους με αποτέλεσμα να προκαλείται όχληση
Η είσοδος ή/και κολύμβηση, το ψάρεμα καθώς και η απόρριψη οποιουδήποτε υλικού, στα υδατορέματα του Εθνικού Δρυμού.
Η κατά οποιονδήποτε τρόπο ενόχληση των άλλων επισκεπτών και των εργαζομένων στην περιοχή.
Η ρύπανση του χώρου γενικά σε όλη την έκταση του Εθνικού Δρυμού. Οι επισκέπτες υποχρεούνται να συλλέγουν και να μεταφέρουν τα απορρίμματά τους εκτός των ορίων του Δρυμού.
Η πρόκληση ζημιών, καταστροφών και βανδαλισμών σε γεωλογικούς σχηματισμούς και σε πολιτιστικά μνημεία και η αναγραφή συνθημάτων κ.α. σε δένδρα, βράχους, περιφράξεις κ.λπ.
Οι αναρριχητικές δραστηριότητες με την επιφύλαξη του άρθρου 3 παράγραφος 7 του Κανονισμού Λειτουργίας.
Η έρευνα καθώς και η φωτογράφιση/κινηματογράφηση για εμπορικούς σκοπούς, άνευ σχετικής άδειας από την αρμόδια υπηρεσία του Υπουργείου Περιβάλλοντος και Ενέργειας.
Η βοσκή κτηνοτροφικών ζώων.
Η εγκατάσταση κυψελών μελισσοσμηνών χωρίς άδεια της Διεύθυνσης Δασών Χανίων.
Η απογείωση, χειρισμός και προσγείωση κάθε είδους ΣΜηΕΑ, πλην εκείνων που έχουν λάβει ειδική άδεια από τις αρμόδιες αρχές.
Η είσοδος και παραμονή επισκεπτών εντός των χώρων των φυλακίων του Εθνικού Δρυμού, πλην όσων φέρουν σχετική σήμανση ή κατόπιν υποδείξεων του αρμόδιου προσωπικού και δασικών υπαλλήλων, όταν αυτό κρίνεται αναγκαίο από την αρμόδια υπηρεσία.
Η χρήση των φωλεών πυρόσβεσης και λοιπών μέσων πυρόσβεσης εκτός σε περίπτωση πυρκαγιάς.